一、建设工程合同纠纷管辖部门如何确定

1、建设工程合同纠纷应当按照不动产纠纷确定管辖部门，即由工程所在地的人民法院进行管辖。工程合同纠纷属于合同纠纷，一并可由被告住所地或者合同履行地人民法院进行管辖。

2、法律依据：《民事诉讼法》

第二十四条因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。

第三十四条下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖：

(一)因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖;

(二)因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖;

(三)因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。

第三十四条

合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。

二、建设工程设计合同纠纷的诉讼时效是多久

诉讼时效的起算也即诉讼时效期间的开始，它是从权利人知道或应当知道其权利受到侵害之日起开始计算，即从权利人能行使请求权之日开始算起。

行使请求权的前提是权利已经确定。工程款未结算，说明双方的权利义务还未确定，行使请求权的条件还不具备，诉讼时效还没有起算。工程结算后，双方的权利义务已明确，债权人对自己的权利是否受到侵犯可以做出明确的判断，因此，诉讼时效的起算点应是工程结算之日后。

“利息从应付工程价款之日计付。当事人对付款时间没有约定或者约定不明的，下列时间视为应付款时间：

1、建设工程已实际交付的，为交付之日;

2、建设工程没有交付的，为提交竣工结算文件之日;

3、建设工程未交付，工程价款也未结算的，为当事人起诉之日”。

按照该司法解释的规定，在工程没有竣工结算的情况下，诉讼时效应分三种情况有上述三个起算点。