劳动纠纷处理程序如下：1、协商程序。协商是指劳资双方直接就争议问题进行协商，找到解决纠纷的具体办法。2、申请调解。因签订和执行集体劳动合同发生争议的，由企业劳动争议调解委员会调解。与协商程序一样，调解程序也是当事人自行选择，调解协议不具有强制性，当事人一方违约时，也可以向仲裁机构申请执行仲裁。3、仲裁程序。申请劳动仲裁是解决劳动争议的可选择程序之一，也是提起诉讼的前提条件，即要提起诉讼解决劳动争议，必须经过仲裁程序，不能直接向人民法院提起诉讼。4、诉讼程序。

一、劳动报酬问题解决途径和办法是怎样的？

劳动报酬问题解决途径：

(1)协商，劳动争议发生后，劳动者既可以直接与用人单位进行协商，也可以请工会或第三方与用人单位进行协商，以达成和解协议，但是协商并非解决劳动争议的必经程序;

(2)调解，用人单位与劳动者之间不愿协商或者协商不成的，可以向办单位劳动争议调解委员会申请调解，调解也不是解决劳动争议的必经程序;

(3)仲裁，劳动争议发生后，双方当事人可以不经协商、调解程序，直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，劳动仲裁是解决劳动争议的必经程序;

(4)诉讼，当事人对仲裁裁决不服的，可以自收到仲裁判决书之日起15日内向人民法院提起诉讼。

二、克扣员工工资劳动者怎么办

1、协商解决。

劳动者与用人单位就劳动纠纷问题直接进行协商，这不是必经程序，双方可以协商，也可以不协商，完全出于自愿。

2、申请调解。

当事人就已经发生的劳动纠纷向劳动纠纷调解委员会申请调解的程序。

调解程序也由当事人自愿选择，调解协议不具有强制执行力，如果一方反悔，同样可以向仲裁机构申请仲裁。

3、仲裁处理。

当事人将纠纷提交劳动争议仲裁委员会进行处理的程序，如果想提起诉讼打劳动官司，必须经过仲裁程序，不能直接向人民法院起诉。

4、诉讼解决。

诉讼程序的启动是由不服劳动争议仲裁委员会裁决的一方当事人向人民法院提起诉讼后启动的程序。