小产权房遇到拆迁,被当违章建筑拆除是合法的。依据我国城乡规划法的规定，如果小产权房是属于违法建筑的，政府是有权拆除违法建筑的，所以并不是违法的行为。

一、违法施工由哪个部门查处

房子在无证的情况下被认定成违法建筑，紧接着相关部门就会给当事人送达限期拆迁通知书或是决定书。此时被拆迁人可能会非常的恐慌，但是这里要告诉大家的是，并不是所有的无证房屋都能认定成违法建筑，而且即便是真违建，在拆除之前也要依法履行相应的认定程序。

二、没房产证的房子拆迁如何补偿

房屋拆迁补偿是针对房屋产权进行的补偿。根据有关的城市房屋拆迁管理法规，被拆迁人是指拆迁房是自己的，没有自己是合法房屋所有权人有关的证明文件无法证明拆迁的是自己的房子，所以不会得到房屋拆迁补偿。该房屋没有取得相应的规划、报建手续无法办理房产证。对违法建筑一律是无偿拆除的。如果不能认定为违法建筑而又无产权证的话则一般是可以获得适当补偿的，但和合法产权的补偿相比要低得多，一般是参照建筑成本进行补偿。

三、违章建筑强拆程序

拆除违法建筑的程序包括调查询问、现场检查、责令停止违法行为，由区规划建设局作出行政处罚决定。对于违法建筑，程序一般是调查询问、现场检查、责令停止违法行为和区规划建设局作出的行政处罚决定。由当地违法建筑所在地乡镇人员进行调查询问，确认是否违法。违法建筑确认后，由违法建筑所在乡镇人民政府责令停止违法行为，予以公告，并要求当事人限期自行拆除。