1、含义不同。3％为小规模纳税人增值税税率；17％为一般纳税人增值税税率。2、享受的税收的政策不一样。小规模纳税人不能抵扣进项税，只有一般纳税人才能抵扣进项税额。一般纳税人抵扣进项税的条件：（1）必须取得增值税专用发票才能抵扣进项税（2）取得小规模纳税人在国税代开的增值税专用发票，可以按3％抵扣进项税。3、发票性质不同。3％的税率在增值税普通发票使用较多的；17％税率常见于增值税专用发票。税法规定必须取得增值税专用发票才能抵扣进项税，进项增值税发票经过认证可以抵扣税金，普通发票不能抵税。

开普通发票和增值税发票区别是？

普通发票和增值税发票的区别主要体现在主体、内容、作用、印制、联次等五方面。

1、主体不同：增值税专用发票只限于由增值税一般纳税人领购使用，小规模纳税人若需使用，需得到批准之后由税务机关代开；而普通发票则可以由已办理了税务登记的各种纳税人领购使用，未办理的也可以向税务机关申请领购使用。

2、内容不同：增值税专用发票具备开票单位、收款人、开票日期、购买单位、销售单位、单价和价款等内容；而普通发票还包括了税务登记号，但不含增值税金额、适用税率、应纳增值税额等内容。

3、作用不同：增值税专用发票不但是购销双方收付款的凭证，还是购买方扣除增值税的凭证；而普通发票只能在运费、收购农副产品、废旧物资的按法定税率作抵扣。

4、印制不同：增值税专用发票是国家税务总局监制设计印制的；而普通发票是按照国务院主管部门的规定，分别由省、自治区、直辖市、地方税务局指定印制的。

5、联次不同：增值税专用发票有四个联次和七个联次两种，而普通发票则只有三联。

《中华人民共和国增值税暂行条例》第四条除本条例第十一条规定外，纳税人销售货物或者提供应税劳务（以下简称销售货物或者应税劳务），应纳税额为当期销项税额抵扣当期进项税额后的余额。应纳税额计算公式：应纳税额期销项税额－当期进项税额

当期销项税额小于当期进项税额不足抵扣时，其不足部分可以结转下期继续抵扣。