分居期间所负债务在离婚时应当确定是否是夫妻共同债务，如果是夫妻共同债务则应当由夫妻双方共同承担，由夫妻的共同财产清偿，夫妻共同财产不足以清偿的，可以由双方协商清偿。

一、民法典规定共同债务如何承担

夫妻共同债务由夫妻共同承担，一般是先以夫妻共同财产清偿。共同财产不足清偿或者财产归各自所有的，由双方协议清偿;协议不成的，由人民法院判决。夫妻双方共同签名或者夫妻一方事后追认等共同意思表示所负的债务，以及夫妻一方在婚姻关系存续期间以个人名义为家庭日常生活需要所负的债务，属于夫妻共同债务。夫妻一方在婚姻关系存续期间以个人名义超出家庭日常生活需要所负的债务，不属于夫妻共同债务;但是，债权人能够证明该债务用于夫妻共同生活、共同生产经营或者基于夫妻双方共同意思表示的除外。

二、如何承担夫妻债务

夫妻共同债务由夫妻共同承担，夫妻个人债务由夫妻一方独自承担。对于夫妻共同债务，即使双方离婚，也应当共同清偿。具体情况分为三种：1、双方的共同财产足以清偿共同债务的，以共同财产来清偿共同债务，剩余财产在双方之间平等分配。2、共同财产不足以清偿共同债务的，由双方协议清偿，如协议不成，由法院进行判决。3、不存在共同财产的情况下，债务由双方协议清偿，如协议不成，仍由法院进行判决。