一般情况下，孩子父亲有乙肝的，不一定可以变更孩子的抚养权。因为乙肝是具有传染性的疾病，不及时治疗会传染给家人。女方可以搜集证据来证明男方身患乙肝不适合跟孩子一起生活，并且向法院提起诉讼，提出更改抚养权。法院通常会按照有益于孩子的健康成长，维护孩子的权益为原则，作出判决。

小三的孩子父亲有抚养权吗

对于第三者生的孩子，丈夫作为父亲，仍然有抚养他们的法律义务。有必要确定父母对未成年子女监护权的归属。两岁以下的孩子通常和父母住在一起。母亲有下列情形之一的，可以与父亲同住：1、患有传染病或者其他长期不能治愈的严重疾病，子女不宜与其同住的；2、他们被要求与父母同住，因为他们有条件赡养他们，但没有义务赡养他们；3、他们确实由于其他原因不能与母亲同住。

《最高人民法院关于适用《中华人民共和国民法典》婚姻家庭编的解释（一）》

第五十六条具有下列情形之一，父母一方要求变更子女抚养关系的，人民法院应予支持：

（一）与子女共同生活的一方因患严重疾病或者因伤残无力继续抚养子女；

（二）与子女共同生活的一方不尽抚养义务或有虐待子女行为，或者其与子女共同生活对子女身心健康确有不利影响；

（三）已满八周岁的子女，愿随另一方生活，该方又有抚养能力；

（四）有其他正当理由需要变更。

第五十七条父母双方协议变更子女抚养关系的，人民法院应予支持。