1、建设目的不同经济适用房的建设具有保障性质，建设目的是为了解决城市低收入住房困难家庭的住房问题，一般商品房建设不以保障为目的。

2、土地性质不同由于能够享受政府优惠政策，经济适用房所占用的建设用地是行政划拨用地，而一般商品住房的建设用地是出让土地，不但要通过公开招拍的程序，而且要按拍卖成交价向政府缴纳土地出让金。

3、享受的优惠政策不同的经济适用室除了享受土地计划的优惠外，还可以在很多方面享受政府的优惠政策。一般商品住宅建设几乎没有优惠政策。

4、定价区别基于经济适用房的建设目的．土地性质及所享有的优惠政策，其价格是由政府限定的。而一般的商品住房价格受市场波动，由开发商自行决定，政府在通常情况下不干预。

5、购房资质区别一般商品房面向公众销售，购房者可根据自身能力主动购买。但申请购买经济适用房有严格的标准，也有严格的审批流程。申请人的住房面积．可支配收入．是否发生过住房交易等均会影响到购买人的申请资格。

6、产权限制区别经济适用房的产权是受到一定限制的，比如其转让需要满一定的年限。而一般的商品住房没有上述限制。