工程合作承包协议不违反法律，就有效。

一、工程内部协议是否有效

工程内部协议有效，工程内部协议只要签字或者盖章就具有法律效力。建设工程施工合同具有下列情形之一的，认定无效：

（一）承包人未取得建筑施工企业资质或者超越资质等级的;

（二）没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义的;

（三）建设工程必须进行招标而未招标或者中标无效的。

二、工程承包合同签订是否有效

个人签订的工程承包协议依法成立即有效。承包建设工程的承包人一般必须具有企业法人资格，同时持有工商行政管理机关核发的营业执照以及建设行政主管部门颁发的资质证书，然后在核准的资质等级许可范围内承揽工程。具备上述要求的签订的承包协议才有效。

三、个人签订工程承包协议是无效吗

个人签订工程承包协议是无效的，从事建筑活动的建筑企业、勘察单位、设计单位和工程监理单位应当具备下列条件：

1、有符合国家规定的注册资本；

2、具有与其建筑活动相适应的具有法定执业资格的专业技术人员；

3、从事相关建筑活动的技术装备；

4、法律、行政法规规定的其他条件。

工程合同的承包人必须具有企业法人资格，持有工商行政管理机关颁发的营业执照和建设行政主管部门颁发的资质证书。