一、主合同补充协议有效吗

合同补充协议作为合同的一部分，与合同具有同等法律效力。合同是当事人或当事双方之间设立、变更、终止民事关系的协议。依法成立的合同，受法律保护。

补充协议是对原合同的补充或者变更，一般要明确约定，如果补充协议条款与原合同不一致或发生冲突时，应当与补充协议为准，但原合同明示不得变更的条款，补充协议中对该条款发生的变更则不发生法律效力。

二、补充协议和主合同有什么关系

补充协议或者称为协议补充，是指当事人对于合同中的内容没有约定或者约定不明确的，而达成的协议。补充协议是相对于已经存在的合同而言的，协议补充就是通过协议方式补充已经存在的合同中存在的漏洞。因此，已经存在的合同与补充协议之间是主从关系。已经存在的合同是主合同，补充协议是从合同。

主合同与补充协议一般不会同时产生，会有时间差，主合同成立时间在前，补充合同成立时间在后，这是补充合同产生的时间规律。

补充协议是主合同的从属合同，补充合同依附于主合同而成立，没有主合同，就不会产生补充合同，这是主合同与补充合同的基本关系。

主合同因为有了补充协议，所以使得主合同原意更准确、更完善、更具有可操作性。补充协议的编号往往是以主合同为依托而表达的。

因为有了补充协议这种特殊形式，能够保证双方履约顺利，合同纠纷减少。

三、主合无效了补充协议是否有效

如果主合同已经实际履行，主合同及补充协议均有效。主合同尚未生效，补充协议内容可独立履行的，补充协议有效；不能独立履行的，效力待定。