证明夫妻分居的证据如下：

（一）法院不认定分居的情形

1、分床不分房，法院难认定是分居因为受到经济条件的限制，大多数的夫妻还只拥有一个住处，或者无力负担长期在外单独租房居住，因此夫妻感情不和后，同房不同床，各自分灶吃饭。在一方提起诉讼离婚时，如果另外一方不承认分居事实，外加夫妻同居是纯属私人事务，他人很难为此作证，因此法院一般不予采信。

2、夫妻异地居住，不一定是法律意义上的“分居”有的夫妻因为就业、学习等的原因并不在一个地方生活，所以地理意义上的夫妻异地居住不一定是法律上说的分居，法律上的分居是以夫妻双方因为感情不和而不存在性生活的共同居住，互相不履行夫妻义务为标志。不过如果异地生活的夫妻相互间感情不和的，也可以构成法律意义上的分居，但是必须要有夫妻双方感情不和的书信等书证及其他证据来证明。

（二）能证明夫妻分居的常见证据。

1、一方在外居住的房屋租赁合同；

2、双方签订的夫妻分居书面协议，一定是要书面的，口头协议必须对方承认；

3、一方向另一方发出的书面分居文书，最好是用快件性质邮寄，在备注栏里注明“分居”，并且保留邮寄凭证，从邮寄之日起到提起离婚期间属于夫妻分居时间；

4、双方来往的书信、电子邮件等能证明双方感情不和分居的事实；

5、人证也可以，比如双方都认识的朋友或者亲戚，不过因为证人往往和为其作证的一方有利害关系及分居是夫妻“私事”，所以单独的证人证言难为法院采信，要辅佐以其他的证据。

二、分居满两年婚姻关系自动解除吗经常遇到有人咨询说分居两年后，婚姻关系是不是自动解除了？在有些国家有夫妻别居制度，比如法国和英国，别居方式有协议别居和法院判决别居两种方式，别居期间双方约定对子女财产等的处分方式，如阿根廷法律不允许离婚，因此夫妻只能长期分居。但是分居（别居）满2年在我国只是判断夫妻感情破裂的一种方式，只要不经过法定的离婚手续，双方的婚姻关系还继续存续，如果此时任何一方与第三方结婚的，即构成重婚罪。