改制后的企业性质可以是国有控股，也可以是非国有控股。改制企业应根据自身的情况进行选择。我们认为，除非改制企业属于关系国家安全和国民经济命脉的重要行业和关键领域的企业，改制应尽量选择非国有控股性质。只有这样，改制企业才能真正实现产权制度的彻底变革，才能做到改制后新企业产权的高度清晰化，才能解决长期困扰着国有企业的政企不分、生产经营自主权难以落实、企业自我调整机制不健全、资本所有者与经营者缺位等一系列问题。需要特别指出的是，此次中央改制政策是鼓励非国有控股形式的，对改制为非国有控股的企业给予优惠政策;改制为非国有控股形式的，原主体企业要依法与职工解除劳动合同，并支付经济补偿金;而改制为国有控股形式的，职工将不能获得解除劳动合同的经济补偿金。如果采取分步改制方式，即先改制为国有控股形式，再改制为非国有控股形式，则不但职工不能得到补偿，而且改制后新企业还是不能摆脱主体企业的控制，主体企业还是要对改制企业指手画脚，影响企业的发展，从而不能实现产权高度清晰，而改制企业也因注意力不能完全集中使主业受到拖累。

在选择了非国有控股后，改制方案的设计者还要对国有资本是否全部退出问题进行抉择。原则上，处于竞争领域特别是一般性竞争领域的国企改制时尽可能选择一步到位，即国有资本全部退出。但也不能一概而论，应根据改制企业的具体情况具体分析。有些改制企业原有业务大部分或全部是为主体企业服务的，改制后新企业的目标市场和客户就锁定在主体企业内部，而且主体企业的业务发展前景良好，市场容量非常大，改制企业在短期内也找不到新的利润增长点，那么选择主体企业参股形式就是一个好的决策。相反，有些改制企业的目前和未来的目标市场主要在主体企业的外部，或虽然目前改制企业仍然对主体企业有一定的依赖性，但已经找到新的利润增长点，改制后能迅速脱离对主体企业的依赖，那么这样的企业最好让国有资本完全退出。