是的，劳动者与单位发生了纠纷，需要通过劳动仲裁的方式来维护自己的权益。在进行劳动仲裁时，要看劳动者跟用人单位的争议是什么，如果用人单位与劳动者是否存在劳动关系的争议，可以申请劳动仲裁。

一、合作协议和劳动仲裁怎么开

合作协议中的当事人不存在劳动关系，一般不能申请劳动仲裁。申请劳动仲裁的条件：用人单位与劳动者存在劳动关系；申请仲裁的争议属于劳动争议；向劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁；申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算；其他。

二、怎样证明事实劳动关系

用人单位未与劳动者签订劳动合同，认定双方存在劳动关系时可参照下列凭证：工资支付凭证或记录(职工工资发放花名册)、缴纳各项社会保险费的记录；用人单位向劳动者发放的“工作证”、“服务证”等能够证明身份的证件；劳动者填写的用人单位招工招聘“登记表”、“报名表”等招用记录；考勤记录；其他劳动者的证言等。因此，劳动者或劳动保障部门可以从以上方面去证明或认定。司法实践中，还可以用公司业务往来的文件，录音证据等来证明劳动关系。如果发生了劳动争议纠纷，建议劳动者首先搜集证据来证明与用人单位存在劳动关系。

三、劳动仲裁对公司有哪些影响

劳动仲裁对公司有以下影响：公司需要依法参与劳动争议仲裁委员会组织的仲裁；按照规定的期限履行发生法律效力的调解书、裁决书；公司拒不履行的，另一方可以申请法院强制执行。

劳动仲裁的主体是用人单位和劳动者，在劳动仲裁的过程中偏向于劳动者这一方，劳动者与用人单位签订合同之后，不能够将劳动者无缘无故辞退，或者逼着劳动者辞退，和做出与劳动合同上不相符的事情，如果损害了劳动者的相关利益，那么劳动者是可以去劳动局申请劳动仲裁的，在仲裁的过程中，需要收集相关证据与不法的信息，在此过程中不会产生费用，有劳动纠纷又解决不了，可以尝试让劳动局来帮助劳动者解决这项纠纷，是可取的。