劳动保障部等三部门《关于印发国有大中型企业主辅分离辅业改制分流安置富余人员的劳动关系处理办法的通知》（劳社部发［2003］21号文件规定，对企业经营管理人员也按照文件规定的标准支付经济补偿金。主要考虑两个方面：

1、企业实行主辅分离、辅业改制时，企业经营管理人员与其他职工一样，在改制过程中劳动关系也要发生变化，或者离开企业，或者进入改制企业。其中，对离开企业或分流到改制为非国有法人控股企业的经营管理人员，同样也应享有经济补偿的权利；

2、经济补偿金主要是针对原国有企业与职工签订的无固定期限的劳动合同进行的补偿，在这一点上，无论是企业经营者还是普通员工的劳动合同性质是相同的，补偿标准也应一致。对解除劳动合同进行经济补偿，更多的是体现公平原则，防止差距过大。特别是在主辅分离时，辅业改制企业多数采取用国有净资产支付解除劳动关系职工的经济补偿金，并在自愿的基础上转为股权或债权，参加改制的职工一般仍有工作岗位。因此，劳动保障部等三部门《关于印发国有大中型企业主辅分离辅业改制分流安置富余人员的劳动关系处理办法的通知》（劳社部发［2003］21号文件规定企业经营管理人员也按照规定的标准执行，即：企业经营管理人员平均工资超过企业月平均工资的3倍以上的，按不高于企业月平均工资的3倍标准计发。