夫妻分居两年不能自动离婚。

我国民法典婚姻家庭编对离婚的方式规定的很明确，只有两种方式：一是，双方协商一致后去民政局办理协议离婚（登记离婚）；二是，一方不同意离婚的，另一方起诉到法院判决离婚。所以，根本不存在自动离婚。

协议离婚，夫妻双方应带着本人的户口簿、身份证；本人的结婚证；双方当事人共同签署的离婚协议书等相关材料，到其中一方户口所在地的婚姻登记机关申请离婚登记，婚姻登记机关查明双方确实是自愿离婚，并已经对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的，经过三十天离婚冷静期的准予离婚且发放离婚证。

诉讼离婚，当事人应带离婚起诉状到其管辖法院提起民事诉讼，经人民法院调解无效的，夫妻感情确已破裂且无修复可能的应当准予离婚。

律师补充：

分居两年不一定能离婚。作为应准予离婚的法定情形的分居，必须是因夫妻感情出现问题，感情不和、感情破裂、相互厌恶而造成的分居。因此，分居两年且能证明夫妻感情破裂的才能离婚。

分居日期从提出离婚的夫妻二人共同认可的最后一次同居的第二天起计算，需要注意的是，分居亦必须要连续两年，中间不能中断，否则可能会被认定双方感情已经和好。

证明是因感情不和而分居的证据：一方在外居住的房屋租赁合同；夫妻分居书面协议；找双方都认识的朋友或者亲戚作证人等。