综合计时工作制加班费的计算方法根据加班时间的不同而不同。如工作日的加班费为不低于劳动者本人小时工资标准的150%进行支付。综合计时工作制的工资不可以低于最低工资，如果低于最低工资标准的应按最低工资标准进行支付。

一、综合计时工作制加班费怎么计算

综合工时制的加班费的计算方法为：工作日的加班费按照不低于劳动者本人小时工资标准的150%支付；休息日按照不低于劳动者本人小时工资标准的200%支付；法定节假日则支付不低于工资300%的报酬。

法律依据：

《中华人民共和国劳动法》第四十四条规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：

（一）安排劳动者延长时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；

（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；

（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

二、综合计时工作制的工资可以低于最低工资吗

综合计时工作制的工资不可以低于最低工资。综合计时工作制，支付给劳动者的工资是不能低于当地最低工资标准的，低于的按最低工资标准支付。若是用人单位支付劳动者的工资低于当地最低工资标准的，劳动者可以进投诉或者申请仲裁。

法律依据：

《中华人民共和国劳动法》第四十八条

国家实行最低工资保障制度。最低工资的具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，报国务院备案。

用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。

第七十七条

用人单位与劳动者发生劳动争议，当事人可以依法申请调解、仲裁、提起诉讼，也可以协商解决。

调解原则适用于仲裁和诉讼程序。

三、什么是综合计算工时制

综合计算工时制指的是用人单位以标准工作时间为基础，以一定的期限为周期，综合来计算工作时间的工时制度。因为工作性质特殊或者受季节及自然条件限制，需在一段时间内连续作业的才可使用这一制度。

《中华人民共和国劳动法》（2018修正）：第五章　工　　资　　第四十八条　国家实行最低工资保障制度。最低工资的具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，报国务院备案。\n用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。