1、规定双方的权利和义务。尤其要说明在分居期间，夫妻双方不再有义务与其丈夫或妻子同居。

2、协议中要说明子女有谁抚养，抚养费如何承担以及探望权如何行使？例如约定了分居期间孩子由哪些抚养，另一方需要承当多少抚养费。

3、可以对分居期间的财产进行约定，如无约定或无法达成协议，则仍视为夫妻共同财产。双方若同意，可以在协议中规定分居期间双方不再互相享有家事代理权（但无法对抗善意第三人），如果一方违反则要赔偿另一方的损失。双方若同意，可以约定分居期间因为一方而产生的债务一律视为个人债务（同样无法对抗善意第三人），一方如果违反要赔偿另一方的损失。

4、分居的期限，应以三个月至两年为限，期限届满，如一方当事人依然认为感情无法复合而要求离婚的，可协议离婚或持该协议向法院起诉离婚。

5、分居的终止。协议分居可基于当事人双方的协议而终止，但应当制作终止分居的书面协议，或办理终止分居的公证。

6、其他的约定的条款。

一、分居期间的收入离婚后是否能分割呢

夫妻分居期间彼此没有联系，此期间各自所得到的财产夫妻分别管理和使用，很多离婚当事人因此而认为此期间所产生的财产可以视为个人财产，这是没有法律依据的。

只要夫妻双方没有办理离婚登记或离婚判决没有生效，则在法律上双方仍然属于夫妻关系，所产生的一切工资、奖金等就应该认定为夫妻共同财产，在分割财产时，应按照共同财产进行分割。具体方法：各自分别管理、使用的财产归各自所有。双方所分财产相差悬殊的，差额部分，由多得财产的一方应当给予另一方必要的补偿。

夫妻关系存续期间所负担的债务，如果是为了共同的生活、共同的投资、对老人和孩子尽赡养抚养义务等双方共同的事由，则债务由双方共同负担；但如果是一方为了赌博、吸毒等非法的事由所负担的债务、在借债时又对另一方进行了隐瞒，则此债务不能视为共同债务。