一、申请做工伤认定公司不配合怎么办

可以自己申请的，也可以通过仲裁劳动关系确认；

申请工伤所需材料：

1、工伤认定申请表；

2、身份证复印件；

3、医院诊断证明或职业病诊断证明；

4、工商企业登记档案资料

5、用个单位与劳动者存在劳动关系的证明（如：劳动合同、厂牌、工卡、证人证词、出入证、罚款单、警告信等）

6、工伤事故报告书

7、上下班途中发生交通事故，需提交交通事故认定书、路线图、房东证明及身份证复印件、邻居证明及复印件。

二、申请工伤认定的时效期限

职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，可由所在单位（30日内）或个人（1年内）向统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。提出工伤认定申请应当填写《工伤认定申请表》，并提交下列材料：

（1）劳动合同文本复印件或其他建立劳动关系的有效证明；

（2）医疗机构出具的受伤后诊断证明书或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）。劳动保障行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定决定。劳动保障行政部门应当自工伤认定决定作出之日起20个工作日内，将工伤认定决定送达工伤认定申请人以及受伤害职工（或其直系亲属）和用人单位。职工或者其直系亲属、用人单位对不予受理决定不服或者对工伤认定决定不服的，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼。