保税港区税收优惠有三个。税务结构相当于国内最优惠的地区。

第一是企业运行中的税务，保税港区里面各类企业一般来说所得税是15%的所得税；从增值税来说，增值税和关税是联在一起的，如果进口的关税不收，进口的增值税也不收；如果出口的关税不收，出口的增值税也不收。保税港区里面关税、进出口增值税有关联的，保税港区的优惠就是进入保税港区没有入关关税和进口增值税。

第二是出关退税，国内已经交税的货物进保税区之后可以办退税的手续。

第三是在保税区里交易过程中不收税。