存疑不起诉案件需要满足的条件：

1、案件已经经过了补充侦查。

2、证据不足，不符合起诉条件的。

一、审查起诉的补充侦查如何进行?

1、退回补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限

2、对于补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。也就是说，案件经过一次补充侦查，人民检察院认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定;如果经过两次补充侦查，仍然证据不足，不符合起诉条件的人民检察院应当作出不起诉决定。

3、人民检察院对已经退回公安机关二次补充侦查的案件，在审查起诉中又发现新的犯罪事实，应当移送公安机关立案侦查;对已经查清的犯罪事实，应当依法提起公诉。

二、如何处理经济案件中证据不足的案件？

经济案件证据不足的案件的处理方式在不同的阶段是不同的。1、经济案在检察院证据不足如何处理人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查，可以退回公安机关补充侦查，也可自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查期限。对于补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。2、在法院阶段：严格按照《刑事诉讼法》的规定，证据不足应当作出证据不足，被指控罪名不能成立的无罪判决。但是在目前的国情下，证据不足的情况下，在量刑上尽量的从轻减轻已经是很不错了。判处无罪的很少。

三、强奸罪证据不足以后怎么处理

根据法律规定，在刑事诉讼中，公安机关侦查终结的案件，一律由人民检察院审查决定是否起诉。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。补充侦查以二次为限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。如果被不起诉人在押，应当立即释放。