分居三年不会自动离婚。首先，无论分居多久，夫妻关系都不会自动解除。从法律上讲，没有婚姻可以自动离婚，离婚需要办理手续。离婚只有两种方式：

1、协议离婚；

2、诉讼离婚。

其次，因分居而离婚的，需要满足一定的条件：要求双方连续两年分居，不履行夫妻义务。双方因感情不和而分居。需要法院调解，没有和解的可能。因此说分居三年后自动离婚是错误的。

怎么可以自动离婚

我国没有自动离婚这种离婚方式，所有无论怎么样都不会自动离婚。如果夫妻想离婚只能到婚姻登记机关办理离婚登记，或者到法院提起离婚，然后等法院判决离婚后才能解除婚姻关系。

注意协议离婚的，必须到一方常住户口所在地的婚姻登记机关办理。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。