员工重大疾病辞退处理一般是支付经济补偿金、或者是支付经济赔偿金。

劳动者换重病病假期间，如果医疗期内，用人单位单方面解除与劳动者的劳动合同属于违法解除，劳动者可以申请劳动仲裁，要求该用人单位支付赔偿金和医疗补助金。

劳动者病假期间，但是已过医疗期，用人单位选择与劳动者解除劳动合同，属于合法解除，但是用人单位需要支付劳动者经济补偿金和医疗补助金，如果用人单位不支付的，劳动者可以申请劳动仲裁。

员工重大疾病公司可予以辞退吗

《中华人民共和国劳动法》第二十九条劳动者有下列情形之一的，用人单位不得依据本法第二十六条、第二十七条的规定解除劳动合同：

1．患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的；

2．患病或者负伤，在规定的医疗期内的；

3．女职工在孕期、产期、哺乳期内的；

4．法律、行政法规规定的其他情形。