补充协议的效力应及于整个合同。补充协议是对原合同的补充或者变更，如果补充协议条款与原合同不一致或发生冲突，应当以补充协议为准，但原合同明示不得变更的条款，补充协议中对该条款发生的变更则不发生法律效力。

一、主合同与补充协议的联系

“补充协议”或者称为“协议补充”，是指当事人对于合同中的内容没有约定或者约定不明确的，而达成的协议。“补充协议”是相对于已经存在的合同而言的，“协议补充”就是通过协议方式补充已经存在的合同中存在的漏洞。因此，已经存在的合同与“补充协议”之间是主从关系。主合同与补充协议的联系：1、补充协议是对主合同未明确事项或变更事项的补充约定。2、效力上一般是优先遵循补充协议约定。3、与主合同不冲突补充协议可以作为主合同的补充，应当有效；当主合同与补充合同产生冲突时，只要主合同中没有“不允许补充协议对主合同修改”的限制条款，一般应以补充合同为准。

二、合同的补充协议怎么写

根据《中华人民共和国民法典》第五百一十条的规定，在合同生效后就合同内容没有约定或者约定不明的可以签订补充协议解决。补充协议应当具备合同的一般条款，属于完备的合同，关于合同的一般包含的条款可以参考《中华人民共和国民法典》第四百七十条的规定。注意补充协议依附于原合同，具有法律效力。

三、合同补充协议是什么?

合同补充协议是对原合同的补充或变更。法律相关规定是，合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。