刑事案件立案后又撤案追诉时效应继续计算，具体理由如下：

1、“追诉”应以刑事立案为起点，追诉时效于立案时停止计算。“追诉”和“追究刑事责任”的内涵不同。

“追诉”是一个程序性概念，而“追究刑事责任”偏重实体价值，其最终实现要依靠立案、侦查、审查起诉以及审判的顺利进行。

立案侦查、起诉等都不能停止追诉时效的计算，只有审判结束才能停止时效进行，因此在追诉时效届满之前必须完成所有的追诉程序直至审判为止。

如果将“追诉”理解为完成追诉活动，即等同于完成追究刑事责任，则意味着追诉时效制度不仅要解决追诉权行使时间问题，还要兼顾解决司法机关的办案期限，这种跨界解决刑事实体法和刑事程序法两个领域的问题显然不妥。因此，侦查机关一旦对刑事案件立案进行侦查，实体法上的追诉时效应停止计算，而让位于刑事诉讼法中的办案期限的起算。

2、侦查机关的撤案行为并非意味着追诉权的彻底放弃

司法实务中，侦查机关对某些刑事案件经过调查出于办案期限届满但证据依旧不足等各种原因可能会撤销案件，同理检察机关也可能在审查起诉阶段作出存疑不起诉决定，其均意味着本次刑事办案流程的结束以及诉讼活动的终结。但事实上我国法律体系并未完全确立“一事不再审”原则。

根据《人民检察院刑事诉讼规则（试行）》第405条规定，对于人民检察院作出存疑不起诉决定的，在发现新的证据符合起诉条件时，可以再提起公诉。

因此，侦查机关撤销案件、检察机关作出不起诉决定甚至于法院作出无罪判决等终止诉讼程序后，在一定条件时仍可以再行立案侦查或者再次提起公诉，即司法机关可以就同一案件再次启动追诉程序。根据追诉时效制度的设计初衷，在撤案后重启追诉程序之前，侦查机关追诉权的行使仍然应再次受到追诉时效的限制。

也就是说，侦查机关立案启动追诉活动，并不意味着追诉时效无限期延长，而只是追诉时效暂停计算，本质上等同于民事诉讼时效的“中止”；侦查机关撤案后，追诉时效期限应该继续计算，新经过的时间与原来已经经过的时效合算在一起，超过追诉时效期限的，则追诉权消灭，侦查机关不得就该案再行立案启动追诉程序。

3、撤案后追诉时效是继续计算，与先前立案前经过的时间累计计算，而非追诉时效“中断”后的重新计算

一方面，追诉时效中断的事由是新的犯罪行为发生中断的法律后果；另一方面，在司法实践中，刑事诉讼程序反复运行的情况比较普遍，特别是在侦查机关撤案后重新立案、检察机关撤诉或者作出存疑不起诉后重新起诉、无期限和次数限制的审判监督程序的启动等案件中表现得尤为典型。

而时效的本质价值在于限制权力与权利，其目的之一在于促使公权力与私权利及时行使。若撤案亦产生追诉时效重新计算的法律后果，极可能为刑事诉讼程序的反复运行提供了制度空间，助长了超期办案、久拖不决等侵犯人权现象的发生。

公安机关在对刑事案件开展侦查之前，需要先确定是否已经过了刑事追诉时效期间，只有由于对已经超过追诉时效的情形，将不会再被追究刑事责任，这也就意味着此类刑事案件没有被立案侦查的必要了。

关于继续犯追诉时效的计算

我国《刑法》第89条第1款规定：追诉期限从犯罪之日起计算；犯罪行为有连续或者继续状态的，从犯罪行为终了之日起计算。根据刑法的这一规定，对继续犯犯罪行为的追诉与一般犯罪的追诉在时效上是有明显区别的，一般犯罪是从犯罪之日起计算，而继续犯则是从犯罪终了之日起计算。从刑法关于继续犯追诉时效的规定可以看出，继续犯无论继续的时间多久，只要犯罪处于继续状态没有结束，整个犯罪时间就没有完结，从开始到结束的犯罪时间都是一个犯罪，按照一罪处理，这就是法律规定继续犯按照一罪论处的法律依据。对继续犯时效的适用，在实践中难以解决，在理论上又颇有争论的是关于重婚罪的时效问题。刑法界关于重婚行为是否属于继续犯问题存在着肯定说与否定说之争：首先，关于重婚罪是不是继续犯问题，肯定说认为，无论重婚者的重婚行为是采用的登记形式还是采用的非法同居形式，其侵犯的客体都是我国民法典中的一夫一妻制度，即使经过登记构成了重婚既遂，但这种非法同居的行为仍然出于继续状态；否定说认为，重婚者进行结婚登记或者非法同居确认其构成重婚行为之日起，犯罪行为即告完成，以后的继续行为对犯罪的成立没有影响。其次，关于重婚罪时效的计算问题，肯定说认为，重婚行为构成犯罪既遂后，非法夫妻关系的继续不仅仅是不法状态的继续，而且也是犯罪状态的继续，因此，对于构成重婚罪的行为，无论重婚时间持续多久，其追诉时效都应当从犯罪终了之日起计算；而否定说则认为，重婚行为构成犯罪既遂后，其婚姻关系的继续已经属于不法状态的继续，而不是犯罪状态的继续，如果以这种不法状态的结束作为追诉时效的起算日，无异于宣布重婚罪不受追诉时效的限制，这样有悖于法理。

司法实践中一般认为，重婚罪是继续犯还是即成犯，应当分别情况而定：对于采取婚姻登记形式构成的重婚行为，重婚行为者已经登记结婚，婚姻关系便形成，犯罪也即告成立，具备即成犯的构成特征，属于即成犯，因此，登记婚姻后重婚的时间是不法状态的继续，而不是犯罪状态的继续；对于以非法同居的事实婚姻形式重婚的行为，与采取婚姻登记形式构成的重婚行为的即成犯不同，非法同居是重婚行为者实施重婚行为的一种既遂形修订刑法一并进行追诉。根据这一司法解释含义，如果犯罪行为开始于新刑法施行之前，继续到刑法生效以后才结束，就应当作为新刑法生效之后发生的犯罪对待，适用新刑法。