依据劳动法及其法律解释，劳动者在法定休假日用人单位应当依法支付工资。工资包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴。劳动者生育或者实施计划生育手术依法享有休假期间，用人单位应当支付其工资，劳动合同、集体合同均未约定的，按照劳动者本人正常劳动应得的工资确定。故该公司应当按照王女士产假前正常劳动期间应得的工资支付其产假期间的工资。由于绩效工资、房补、交通补助、通信补助列入工资单内，属其产假前正常劳动期间的工资性收入。因此，综上所述，年终奖是职工工资中的一种，在休产假期间不能进行扣除。

生育津贴怎么扣除已发工资

生育津贴要扣除每月实发工资进行发放。

有三种情况：

1、产假期间公司发放的工资和社保局发放的生育津贴不能同时享受，如果单位有交社保，产假期间企业无需向职工支付工资，而是由公司凭女职工的生育凭证，到生育保险基金处为其申请生育津贴，以生育津贴作为女职工产假期间的工资；

2、若企业为职工缴纳的生育保险费基数低于女职工上年度平均工资收入，那么将导致女职工领取的生育津贴低于其正常出勤期间的工资，企业需要予以差额补足；

3、如果单位没有交社保，产假期间公司应当按正常出勤发放工资。

《女职工劳动保护特别规定》第八条女职工产假期间，停发工资，变化产生生育津贴，对已经参加生育保险的，按照标准的工人平均月薪的用人单位由生育保险基金支付对未参加生育保险的女职工，产假前由用人单位按照工资标准支付。对参加生育保险的女职工生育津贴，已包括去年的全部职工奖金，扣今年产假期间的奖金，年终奖不违法没有参加勇敢表现的，应当按照产假前的工资标准发给，应当刚好减去加班工资的剩余工资（奖金属于工资范畴）。