双方协商，协商不成的可以起诉。同居关系有子女的一般为非婚生子女，非婚生子女与婚生子女享有同样的权利与义务。因此如果同居时有子女抚养权纠纷的，和婚生子女一样通过父母双方协商，如果协商不成的可以提起诉讼。

一、谁能拥有同居子女抚养权？

非婚生子女与婚生子女享有同等权利。在同居子女抚养权的处理上，非婚生子女也与婚生子女在父母离婚时的处理一致，先协商，协商不成再由法院判决。

孩子不足两周岁的以母亲抚养为原则；两周岁以上的，如双方因抚养问题发生争执不能达成协议时，由人民法院根据子女的权益和双方的具体情况判决；十周岁以上的孩子，法院会参考孩子的意见。

二、婚生子女和非婚生子女有啥区别

（一）两人的关系属于同居，同居是指两个人出于某种目的而暂时居住在一起，现一般用于异性之间。同居跟结婚不一样，结婚是获得了法律的承认的夫妻关系，是不可以随便解除关系而必须要通过一定的法律程序；而同居是不被法律承认的一种行为，可以随时出于当时人的意愿而终止关系。同居各方都没有任何法律保障。

（二）实际上，按照《民法典》的规定，不管是婚生子女还是非婚生子女，都是平等的。不能说男女没有结婚，非婚生子女就不是父母的孩子，非婚生子女与父母之间的血缘关系是任何人都无法否定和分割的。因此，同居生的孩子的法律地位与婚生子女是相同的。同居生的孩子享有被父母抚养的权利、继承的权利以及其他婚生子女所享有的一切权利。

三、非婚生子女抚养费标准在什么法律法规

法律规定非婚生子女享受和婚生子女一样的权利。非婚生子女的生父母，应负担子女必要的生活费和教育费的一部分或全部，直至子女能独立生活为止。因此，非婚生子女的抚养费既可以由父母双方协商决定，也可由法院直接判决。

2021年1月1日生效的《民法典》第一千零七十一规定，非婚生子女享有与婚生子女同等的权利，任何组织或者个人不得加以危害和歧视。

不直接抚养非婚生子女的生父或者生母，应当负担未成年子女或者不能独立生活的成年子女的抚养费。