可以开，子公司和母公司是独立的纳税主体，子公司既然已经发生了销售行为，就应该开增值税专用发票，这样子公司可以确认收入，母公司可以抵扣进项，是最完整的业务。

一、子公司和母公司可以是同一股东吗？

可以。母公司是子公司的股东，子公司虽然是独立的法人，可以在自己的经营范围内从事各种经营活动，但其自主性是有限的。母公司在子公司的股东会上起主导作用，子公司的经营方针和投资计划实际上是母公司决定。母公司拥有子公司，除了极少数通过协议控制外，基本通过投资实现。虽然子公司是独立的法人，母公司与子公司名义上生产和经营等各方面各自享有自主的权利，但事实上存在管理与被管理关系。母公司与子公司之间的关系，特别是它们之间的控制关系，可被利用，比如操纵子公司转移定价、避税、对抗公共政策或逃避其应承担的法律责任等等。

二、集团公司的法律特征是什么？

1、是从属型联合企业集团的核心企业，其法律地位为母公司（也称支配企业）。

2、其组织形态要符合法律规定的公司形态：有限责任公司或股份有限公司。

3、是混合型控股公司。除对子公司实际控制外，本身还直接进行经营活动，在法律上必须符合国家有关控股公司的规定。

4、母公司与子公司的基本关系是股东与公司的关系，即母公司是子公司的股东，子公司是独立的公司法人。

5、母子公司在持股和特别义务上有法律规定：禁止相互持股（不得反向持股）；一般各自独立负债，不存在企业集团的共同债务。在特殊情况下，母公司才对子公司的债务负责（如母公司承诺了担保）。

6、会计制度：

（1）母公司必须制作集团结算报告，必须制备集团合并会计报表；

（2）合并会计报表仅是用于股东、公众和政府对集团经营状况的了解和掌握；

（3）纳税和核算均以集团内各独立法人为单位。

7、管理关系。在从属型联合企业集团中，集团公司代表企业集团实行统一管理。它有权以集团名义行使集团所拥有的权力，但同时也承担集团所负有的义务。一般来讲，在从属型联合企业集团中，集团管理机构应由集团成员自行协商依集团章程而定。集团管理机构往往与集团公司的管理机构是合二为一的（也可以称作合署办公）。因此，集团公司不仅要追求公司自身的利益，而且要追求和兼顾整个集团的利益，即集团成员的利益。其中，由于母子公司关系的特殊性，子公司有经营自主权，但受母公司控制。母公司对子公司：

（1）制定统一的发展战略和长期规划；

（2）生产能力的扩大或开拓新经营领域；

（3）产权转让和兼并其他公司；

（4）子公司董事长和董事的选派。

8、集团公司与子公司以外的集团成员企业的关系，特别是如何实现统一管理依集团章程而确定。

总公司具有法人资格，但分公司不具有法律上和经济上的独立地位。

三、子公司法人和总公司法人是不是同一个

子公司法人和总公司法人并不是同一个。子公司也有着独立的法人人格；子公司是其一定数额的股份被其它公司持有而由其它公司控制的公司；持有其它公司股份并能控股的是母公司；母公司与子公司是股份控制的经济关系，子公司具有法人资格。

1、子公司是指一定比例以上股份被另一公司持有或通过协议方式受到另一公司实际控制的公司。虽然子公司受母公司的控制，但在法律上，子公司仍是具有法人地位的独立企业。它有自己的名称和章程，并以自己的名义进行业务活动，其财产与母公司的财产彼此独立，对各自的债务各自负责，互不连带；

2、子公司依法独立承担民事责任。子公司在经济上受母公司的支配与控制，但在法律上，子公司是独立的法人。子公司的独立性主要表现在拥有独立的名称和公司章程，具有独立的组织机构，拥有独立的财产，能够自负盈亏，独立核算，以自己的名义进行各类民事经济活动，独立承担公司行为所带来的一切后果与责任。