子公司可以给母公司开票，子公司和母公司是独立的法人。如果有业务往来，需要开发票，两家公司都要交税。总公司和分公司是不同的。承包人仍以分公司名义对外经营的，分公司的生产经营收入由总公司代收代缴。虽然分行是分开核算的，但它们的资产、负债、收入、成本、费用和净资产仍然是总公司的一部分。《中华人民共和国公司法》第十四条规定，公司可以设立分公司。

子公司与母公司的关系

一是控制关系。

子公司虽然是独立的法人，可以在自己的经营范围内从事各种经营活动，但其自主性是有限的。

母公司在子公司的股东会上起主导作用，子公司的经营方针和投资计划实际上是母公司决定。

二是投资关系。

母公司拥有子公司，除了极少数通过协议控制外，基本通过投资实现。

《中华人民共和国公司法》第十四条

公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。