1、企业合并程序由董事会决议。公司合并应首先经由董事会作出合并决议。尽管我国公司法没有对董事会的合并决议作出规定，但这确属应有之义。

2、企业合并程序股东会决议。公司合并对公司的重大变更事项，对股东利益影响甚大。因此，公司合并必须经由股东会同意后方可实施。我国《公司法》规定，其决议方法，在有限责任公司，必须经代表2／3以上有表决权的股东通过。

3、订立合并协议。《公司法》第174条规定，企业合并，应该由合并各方签订合并协议。合并因当事公司之间的合同而成立。一般来讲，在公司合并实践中，往往是公司管理层在得到公司董事会的授权后即进行合并谈判，并代表双方公司拟定合并协议。

4、政府批准。如果合并需要取得主管机关审批的，则需要取得其批准。如修订以前的《公司法》规定，股份有限责任公司的合并必须经国务院授权的部门或者省级人民政府批准。

一、企业合并好处

1．吸收技术和经营管理能力，如为了获得某项技术，购买掌握这项技术的企业；

2．加快企业发展，如为了尽快扩大市场占有率；

3．经营和生产多角化；

4．控制原材料、资源、以获得更大的市场支配力；

5．获得税收、金融上的好处，这种动机与政府政策和金融企业的政策有关；

企业合并程序采用特殊性税务处理的：

除应同时符合财税［2009］59号文件规定的五项条件外，被合并企业股东在合并中取得的股权支付额不得低于其交易支付总额的85％，或者是同一控制下不需要支付对价的企业合并。符合上述条件并选择适用特殊性税务处理的，其转让的资产价值分两部分：一部分是对应于股权支付的资产价值，不确认资产转让所得或损失，直接以资产、负债在被合并企业时的计税基础作合并企业接收的资产、负债的计税基础，被合并企业合并前的相关所得税事项，由合并企业承继；另一部分是对应非股权支付的资产价值，按非股权支付金额占被转让资产公允价值的比例确认转让所得或损失。

二、公司合并有哪些限制呢

我国公司法对此没有规定，在理论上，这一问题存在三种学说：

（1）自由说。认为公司合并并不应有种类的限制。

（2）严格限制说。认为只有同种类公司方可合并，并且，合并之后的公司仍应为同种类公司。

（3）适当限制说。认为对不同种类公司的合并采取适当限制。

许多国家的公司立法采取了适当限制说，对不同种类的公司之间的合并以及合并后的公司类型作了限制。如德国规定股份有限公司可以接收有限责任公司，但有限责任公司不能接收股份有限公司。再如日本《有限公司法》第59条规定，有限公司可以与其他有限公司合并，但合并后存续的公司或因合并而设立的公司，须为有限公司；第60条规定，有限公司与另一股份有限公司合并，应经法院认可，否则无效。我国台湾地区《公司法》对公司合并没有限制性规定，但台湾经济部1988年3月21日经商字07610号文件对此作了解释：现行公司法对于合并公司之种类和合并后存续或另立公司之种类，未有明文限制。为奖励合并，凡属责任相同之公司得予合并，故股份有限公司得与有限公司合并。惟依公司法第317条之一规定，股份有限公司与有限公司合并者，其合并后存续或新设公司，应以股份有限公司为限。学者认为，适当限制说比较合理，应成为我们处理这一问题的基本思路。