一般扣工资会有下面三个情况： 1、出勤天数未达到合同约定的天数，这个要按照基本工资除以应出勤天数再乘以请假天数，得出应扣除的工资； 2、工作期间违反公司规章制度或其他惩罚条例（比如打架、旷工、质量事故等），具体的金额根据公司的规定执行； 3、绩效扣分，一般公司的工资体系里会有绩效工资，也就是拿出一部分工资，根据绩效评价来发放，只有达到满分才能全部拿到，这个具体要参考公司的绩效体系是怎么构筑的； 若企业扣工资没有合法合理的理由，劳动者可以向劳动监察部门投诉，获得自己应得的工资。
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公司制度规定旷工扣三倍工资不合法。单位扣除工资最高只是当日工资的百分之七十，或月终奖金的百分之三十。而扣除三倍工资显然已经超过了上述合理范围，所以单位规章制度中的这种规定是不合法的。这种规定也是无效的，劳动者不必执行。
因劳动者违反公司规定而扣除全部工资是不合法的。若劳动者违反公司规定给用人单位造成经济损失的，可从劳动者本人的工资中扣除来弥补经济损失。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。劳动者在用人单位扣除工资过多时可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
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