如果事业单位工作人员长期不上班，可以按照旷工处理，如果旷工或因公外出、请假期满无正当理由逾期不归，连续超过15个工作日，或者一年内累计超过30个工作日，事业单位可以解除聘用合同。 根据我国《事业单位工作人员管理条例》第二十五条规定：工作人员有下列情形之一的，事业单位可以解除聘用合同： (一)在试用期内被证明不能完成岗位职责任务，或者不能达到工作标准的； (二)旷工或者因公外出、请假期满无正当理由逾期不归，连续超过15个工作日，或者一年内累计超过30个工作日的； (三)同时与其他单位建立人事关系或者劳动关系，拒不改正的； (四)严重失职，对本单位造成重大损害的； (五)违法违纪，损害本单位利益或者公共利益的。
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事业单位工作人员旷工处理根据具体旷工天数而定。事业单位工作人员连续旷工超过15个工作日，或者1年内累计旷工超过30个工作日的，事业单位可以解除聘用合同。自聘用合同依法解除、终止之日起，事业单位与被解除、终止聘用合同人员的人事关系终止。
如果劳动合同对此没有约定，一般按照国家规定的上班时间，也就是周一到周五，公司擅自改变上班时间，需要跟员工协商，如果协商不一致，员工不去上班不能算旷工。要根据该职工有实际工作或休息时间安排来分析： 1、如果星期 六、星期天是该职工的正常休息日的，根据法律规定，在休息日进行加班要取得职工本人的同意，如果职工在星期 六、星期天不去上班的，不属于旷工。 2、如果根据用人单位的工作安排，星期 六、星期天是该职工的正常上班时间而非休息时间的，则职工未经单位同意而不去上班的，就属于旷工。
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