被检察院决定不起诉决定的当事人是否会有案底要视具体情况而定：

（1）如果犯罪嫌疑人是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉的，则不会有案底。

（2）如果犯罪嫌疑人不是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉；

而且因犯罪情节轻微或具有《刑事诉讼法》第十六条规定的情形之一而被不起诉的，仍会有本应的案底记载。

一、终止侦查后有案底吗

只有触犯法律，被判处刑罚的，才会有案底。侦查终结是侦查程序的最后一项工作，也是侦查程序的一个必经阶段。它要求侦查机关通过对已收集证据的审查判断，确定犯罪嫌疑人是否有罪并向检察机关提出起诉意见或者作出撤销案件的决定。如果确定有罪，就会有案底，否则没有案底。

二、人民检察院对哪些案件可以决定不起诉

根据《刑事诉讼法》第十六条规定，人民检察院可以决定不起诉的案件有：

（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；

（二）犯罪已过追诉时效期限的；

（三）经特赦令免除刑罚的；

（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；

（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；

（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。

第一百七十七条规定，犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。

对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。

三、刑事案件怎么撤案

对于自诉刑事案件，我国刑诉法第212条规定“可以进行调解，自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。”但如果是“被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件”则不适用调解。而对于公诉案件，撤案的决定权在公安机关，检察院可以决定不起诉，被害人可以就刑事附带民事部分接受调解。《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条规定，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：(一)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;(二)犯罪已过追诉时效期限的;(三)经特赦令免除刑罚的;(四)依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;(五)犯罪嫌疑人、被告人死亡的;(六)其他法律规定免予追究刑事责任的。因而，刑事案件如果是公诉案件被害人无法撤案，只有自诉的刑事案件才能够自行撤案。