房屋确权有争议的可以通过和解、协商、仲裁、诉讼处理。双方应按照平等互利的原则私下进行和解，和解不成可提请第三方加以协商解决；协商不成时可以交由双方约定指定机构进行仲裁，仲裁仍未解决的可以向人民法院提起诉讼。

房屋产权争议纠纷如何处理

1、首先是协商解决

《土地管理法》第16条第1款规定：土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决。据此规定，公民之间发生的农村房屋所有权纠纷，应当先通过协商的方式加以解决。

2、其次是行政解决

《土地管理法》第16条第2款规定：个人之间，个人与单位之间争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。该法还规定，侵犯土地的所有权或者使用权争议，由县级以上地方人民政府土地管理部门责令停止侵犯、赔偿损失。

3、再次是司法解决

《土地管理法》第16条第3款规定：当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。这表明公民之间就土地的使用权和所有权发生的纠纷，只与按照《土地管理法》第16条和第53条的规定，先经过有关行政机关的处理，对于处理决定不服，才可以向人民法院提起诉讼。否则，人民法院不予受理。但对于侵犯土地的所有权或者使用权的，被侵权人可以不经行政机关的处理，而直接向人民法院起诉。

4、最后，农村房屋所有权纠纷还可以通过人民调解来解决。

人民调解是指在调解委员会（包括城市的居民委员会和农村的村民委员会）的主持下，以国家的法律、法规规章、政策和社会公德为依据，对民间纠纷当事人进行说服教育、规劝疏导，促进纠纷当事人互相谅解，平等协商，从而自愿达成协议，消除纷争的一种群众自治活动。

中华人民共和国仲裁法第二条

平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。

中华人民共和国民事诉讼法第一百二十五条

当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。

中华人民共和国民法典第五百零九条

当事人应当按照约定全面履行自己的义务。当事人应当遵循诚信原则，根据合同的性质、目的和交易习惯履行通知、协助、保密等义务。当事人在履行合同过程中，应当避免浪费资源、污染环境和破坏生态。