根据增值税的征收特点，运用电子密码、税控黑匣子和n卡技术，解决增值税专用发票的防伪和增值税税源控制问题的计算机管理系统。该系统是“金税工程”的重要组成部分。具体操作方法是：销货方利用该系统（通过计算机）开具增值税专用发票，一方面系统将根据开票的金额、税额、购销双方税务登记号等信息形成一套密码并打印在增值税专用发票的左上角，另一方面系统将开票情况记录到黑匣子中以便税务机关掌握企业税源；对于企业取得的增值税专用发票抵扣联，税务机关将通过防伪税控系统检验其密码与票面内在是否相符，然后判断其是否真实。

从1994年下半年国家税务总局在若干城市选择部分企业进行增值税防伪税控系统的试点。从1996年1月日起，全国取消百万元版、千万元版增值税专用发票，凡一次开票其销售额达到百万元以上的，均纳人增值税防伪税控系统，利用该系统开具电脑增值税专用发票。通过该系统开具的增值税专用发票具有两个特征：一是在增值税专用发票的左上角打印60位电子密码，同时在右上角打印该份增值税专用发票号码，与增值税专用发票原有号码相同；二是试点企业如发生退货或销售折让需开具红字增值税专用发票的，改为开具负数增值税专用发票：在增值税专用发票右上角打印“销项负数”字样，在用阿拉伯数字填写的金额、税额前打印“-”号，在价税合计（大写）前打印“（负数）”广字样。