合同的补充协议并不是优于主合同的，而是依附于主合同。补充协议又称为协议补充，是指合同双方就主合同中合同条款没有约定或者约定不明确的，协商一致而达成的协议。故可以判断出，补充合同与原合同是主从关系。原的合同是主合同，补充协议是从合同。

一、应该如何判定补充协议效力

判定补充协议效力的标准：

1、两份合同都有法律效力。如果内容相互冲突，后面的合同可以推翻之前的合同约定。如果主合同的原条款仍然以主合同为准，则补充合同的存在将失去意义；

2、主合同和补充合同一般不同时产生，会有时差。主合同的成立时间在前面，补充合同的成立时间在后面。这是补充合同产生的时间规律；

3、补充合同是主合同的从属合同，补充合同是主合同依附于主合同而成立的，没有补充合同，主合同就不会产生补充合同，这与主合同有更基本的关系。因此主合同更加准确。

二、签补充协议注意有哪些

签补充协议注意：补充协议当事人应与主合同当事人保持一致；补充协议的形式应严格按照订立合同的形式，应与主合同保持一致；补充协议的内容与主合同内容不能发生矛盾。合同“补充协议”或者称为“协议补充”，是指当事人对于合同中的内容没有约定或者约定不明确的，而达成的协议。

三、签订补充协议需要哪些条件

1、只要不违反法律的禁止性和限制性规定,且充分尊重当事人双方的意思自治，协议内容合法有效的话，补充协议与主合同的效力是同等的。2、在补充协议与主合同发生冲突时，视为对主合同的变更或撤消，其效力优于主合同。即补充合同中与主合同相冲突的条款，补充协议的条款优先适用。3、双方需要在补充协议中明确补充原合同的效力范围，明确补充主合同是在原来的范围之内生效还是有所变动、如何变动等。4、补充协议是以主合同的成立和有效为前提的，如果欠缺主合同成立的必备条件和必要条款，或者主合同被确认无效或者被撤销，就没有签订补充协议的必要了。