一、施工合同补充协议效力怎么认定

施工合同补充协议效力的认定要从以下几个方面来讨论：

1.补充协议是否具备下列条件，只有同时具备下列条件的协议才是有效的：

（1）行为人具有相应的民事行为能力；

（2）意思表示真实；

（3）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。

2.补充协议与主合同的内容冲突时，补充合同的效力优于主合同的效力。因为补充协议可以视为合同双方主体对合同的变更协商一致了，不过这个新的约定一定要明确约定，不能模棱两可。补充协议中一般都会在尾部写明“原合同与本补充协议不一致的，以补充协议为准。”原合同明示不得变更的条款，补充协议中对该条款发生的变更则不发生法律效力。

二、建设工程施工合同的特征

建设工程施工合同有如下特征：

1.须遵守国家的法律和政策。

2.签订建设工程施工合同必须具备以下基本条件：工程的初步设计和总概算已经批准;工程所需的投资和统配物资已经列入国家计划;当事人双方均具有法人资格;当事人双方均具有履行合同的能力;

3.建设工程施工合同的主体具有连带的经济权利和经济义务关系;

4.建设工程施工合同的承包人必须是经国家主管部门审查、核定、批准的专业施工企业，具有法人资格。

三、施工合同被确认无效后，如何赔偿损失呢？