商店违约金按合同中的违约金条款计算。

根据《民法典》第五百八十五条第一款、第二款的规定，当事人可以约定一方违约时，应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定违约造成的损失赔偿的计算方法。

约定违约金低于造成损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求增加；约定违约金过高造成损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求适当减少。

商铺违约金的赔偿标准

我国法律并没有对商铺租赁合同违约金的数额做任何规定，违约金的数额应由双方当事人协商。所以，商铺租赁合同违约金的数额应根据实际情况，自行协商。对于违约金，合同当事人可以协商确定。另外，约定的违约金低于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。所以，具体情况，请当事人自行根据实际情况及相关法律规定进行核实确定。

《中华人民共和国民法典》第五百七十八条当事人一方明确表示或者以自己的行为表明不履行合同义务的，对方可以在履行期限届满前请求其承担违约责任。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。

约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。