政府征收土地闲置三年的处理方式是：可以主张恢复耕种，连续二年未使用的，经原批准机关批准，由县级以上人民政府无偿收回用地单位的土地使用权；

该幅土地原为农民集体所有的，应当交由原农村集体经济组织恢复耕种。

农民不同意征收土地政府能强制征收吗

农民不同意征收土地政府不能强制征收，土地征收的关键不在于农民是否签字同意，而在于是否是合法的。如果是合法的征地，农民不签字也是没有用的，因为征地是国家行为，是市县政府代表国家进行的。

判断征地是否合法，最简单的就是看是否有两公告：市县政府发布的《征用土地方案公告》和国土局发布的《征地补偿安置方案公告》，这两公告都要张贴于被征地所在地的村组，老百姓可以看到。如果没有这两公告，则可以认定征地不合法。对于违法的征地，农民当然有权拒绝，当地政府也不能强占。

当然，各地的违法占地案件不时发生，如果真的遇到这种情况，建议两点：一是依法维权，因为农民只有法律这一个武器；二是联合，最起码要联合大部分人。

根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第三条，房屋征收与补偿应当遵循决策民主、程序正当、结果公开的原则。