申请国家赔偿的确认违法案件由赔偿义务人的同级别人民法院进行管辖。

一、法院的管辖分为哪些

法院的管辖可以根据不同的标准进行分类，最常用的是级别管辖权和区域管辖权。人民法院一级管辖是划分上下级法院受理一审民事案件的分工和重要权限。区域管辖是指同级人民法院在各自管辖范围内确定审判第一审经济案件的分工和权限。诉讼管辖是指各级法院之间以及不同地区的同级法院之间，受理第一审民事案件、经济纠纷案件的职权范围和具体分工。

二、民事诉讼程序不同法院的级别和管辖范围

民事诉讼阶段中，不同法院的级别和管辖范围：

1、基层法院管辖第一审民事案件，但法律另有规定的除外；

2、重大涉外案件、在辖区内有重大影响的案件、最高人民法院确定由中级人民法院管辖的案件由中级法院管辖；

3、高级人民法院管辖在本辖区有重大影响的第一审民事案件。

三、怎样确定法院的管辖法院

管辖法院的确定：

1.级别管辖。法院系统内部确定上下级法院之间受理第一审民事案件的分工权限的法律制度。

2.地域管辖。按照人民法院的辖区和民事案件的隶属关系来划分同级别、不同地区人民法院之间受理第一审民事案件的分工和权限的法律制度。

3.专属管辖。法律规定某些案件必须由特定的法院管理，当事人不能以协议的方式加以变更。

4.特殊地域管辖。特殊地域管辖主要适用于经济合同纠纷，保险合同纠纷，票据纠纷，侵权行为提起的诉讼等。