在特许加盟合同中，需要注意以下几个问题。首先，加盟商的主体资格应在合同中明确表述，允许加盟者在某地开设连锁店，拟开设的连锁店名称为某某公司（特许盟主名称）某某连锁店。其次，双方关系的表述也应在合同中约定，加盟者和特许盟主之间不存在任何共同投资、代理、雇佣、承包关系，加盟者使用的商标、商号、商誉和经营管理技术归特许盟主所有。最后，特许加盟合同中应明确约定知识产权保护条款，包括商标、专利、专有技术、域名保护等。以上是特许加盟合同需要注意的问题。