专项附加扣除办理申报流程包括两种途径，分别是由单位办理申报和个人自行申报。

1、由单位按月发工资预扣税款时办理。除大病医疗以外，对其他五项扣除，可以选择在单位发放工资薪金时，按月享受专项附加扣除政策。

2、自行在年度综合所得汇算清缴申报时办理。

2019个税专项附加扣除是什么

2019年个人所得税的免征额从3500元提升到了5000元，这意味着月工资在5000元以下的人都不需要缴纳个人所得税了。

根据新个税法的内容，个税计算方式为：应纳个税＝（应发工资－社保费－起征点－专项附加扣除）相应税率。其中，起征点和专项附加扣除以及税率表都做了调整，将大大降低上班族的纳税额。什么是个税专项附加扣除呢？简单来说：以下几条即为个税专项附加扣除：

（1）子女教育专项附加扣除：每个子女，每月1000元（每年12000元）的标准定额扣除，主要包括接受学前教育和学历教育的相关支出。

（2）继续教育专项附加扣除：学历教育期间按照每年4800元（每月400元）定额扣除；

（3）大病医疗专项附加扣除：个人负担超过15000元的医药费用支出部分，5000元／月（60000元／年）扣除；

（4）住房贷款利息／住房租金专项附加扣除：1000元／月或1200元／月扣除。

《个人所得税专项附加扣除暂行办法》第二条

本办法所称个人所得税专项附加扣除，是指个人所得税法规定的子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等6项专项附加扣除。