工程结算审计是对施工单位在工程竣工或年度终了时，与建设单位所办理的工程价款结算的审计。其主要内容：（１）中间结算（含跨年）检查工程形象进度的工程量，施工产值和预算成本是否正确、真实、本期应结工程价款净值是否与本期实际完成的施工产值或结算价值，扣除预收工程款、抵扣备料款、甲方材料款以及其他应扣款后的余额相符；（２）竣工结算，应审查竣工质量验收、竣工决算的合规性，未完部分尾工预提费用的合理性以及双方经济往来是否清楚，有无违反结算纪律行为。结算时，除了合同约定的项目和金额，还有变更单、甲方与监理签字盖章的所有变更、新增、调减的项目单据，月进度款单据、超过一定百分比比如10％的材料涨价凭证等等，都纳入工程款结算。详细流程是：１、核对与编制好结算资料基础。任何一个工程项目，在编制结算时都要以相关资料依为依据。因此在审核时，首先要对相关资料进行审查。２、工程量是审核的关键。工程量、价是工程造价的主体。运作中具有较大的弹性和隐蔽性。审核工程量是重点，也是难点。３、定额单价的审核不可忽视。在一般情况下，工程的定额单价都有具体规定，编制工程结算时只要参照定额单价的明细子目直接就可以套用。然而在实际操作中，定额单价套用往往出现差错。４、其他费用的审核坚持合情合理。其他费用，由于计算方法不同于工程量和定额单价的套用，故在审核中要根据费用的发生具体对待。