申请劳动仲裁后确认劳动关系补缴社保流程有以下两点：

1、看双方提供的相应证据材料。如劳动合同、工资发放的证据、工作通知之类邮件，微信群等、业务合同等；

2、补缴社保，主要还是仲裁裁决，然后公司超过裁决期限未提出司法申诉，到当地社保局提交补缴申请，通过计算划款即可。

用人单位与劳动者建立劳动关系的，应当自劳动关系确立之日起订立书面劳动合同，如果没有签订劳动合同的，应当自用工之日起签订。

补缴社保流程是什么

社保断交后可由单位进行补缴，只需向单位提供个人身份证，之前的社保缴纳证明即可。

若需要个人补缴，则需前往社保局办理。以北京市为例，可用以下机构办理社保补缴：

1．前往参保地的区（县）社会保险基金（事业）管理中心、市经济技术开发区社会保险基金管理中心和北京市社会保险代办机构办理社保补缴。

2．自行操作使用安装在社保经（代）办机构服务区的自助终端进行补缴。

3．登录北京市社会保险网上服务平台进行补缴。

社保补缴后，自缴费之月起6个月后发生的门急诊和住院医疗费用，由基本医疗保险基金可按照医保报销标准予以支付。但符合下列情况之一的，自缴费之月起发生的门急诊和住院医疗费用，由基本医疗保险基金支付：

（一）与用人单位终止、解除劳动关系后60天内按本办法参加基本医疗保险并缴费的；

（二）失业人员在停止领取失业保险金后60天内进行就业登记并按本办法参加基本医疗保险并缴费的。

灵活就业人员按本办法参加基本医疗保险应当连续足额缴纳费用。逾期3个月未缴费，间断后再次缴费的，按本办法初次参加基本医疗保险的情况享受待遇。

《中华人民共和国社会保险法》第四条中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。

个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。