借款人房贷还清的情况下，保证金是可以退还的。房屋贷款保证金，是指按揭贷款保证金是银行在按揭贷款过程中按照贷款总额的一定比例向开发商收取的钱，并承担按揭贷款的连带保证责任，直至房产证办理出来并完成抵押登记后，银行才将按揭贷款保证金退回开发商。

按揭房贷款的流程

按揭房再贷款流程：

1、借款人向银行提交书面贷款申请书并提交贷款的相关资料；

2、买卖双方在贷款行开立账户，购房者将首期购房款足额存入贷款行指定的账户；

3、经贷款银行调查、审查和审批后，借款人与贷款行签订借款合同；

4、房屋买卖在房屋登记管理部门办理房屋过户并办理保险、公证和抵押登记手续。

《个人住房贷款管理办法》第二十三条借款人不能足额提供抵押（质押）时，应有贷款人认可的第三方提供承担连带责任的保证。保证人是法人的，必须具有代为偿还全部贷款本息的能力，且在银行开立有存款帐户。保证人为自然人的，必须有固定经济来源，具有足够代偿能力，并且在贷款银行存有一定数额的保证金。