甲公司在某区设立两家分公司，皆为房屋中介门店。A为其中一家分公司法定代表人，B为另一家分公司法定代表人;A、B与甲公司成为事实上的挂靠关系，即以甲公司分公司的名义经营，甲公司收取管理费，此关系有甲公司口头认可，有相关票据支撑，但并无书面协议支持。A、B共同经营两家分公司(两个房屋中介门店)，成立事实上的个人合伙关系，双方2007的一份分家协议书面确认该关系，并经双方签署。

分家协议系因A、B双方合作不快而产生，双方约定结束合伙关系，分家后双方各自经营其中一家门店。分家协议中对该两家门店的收支情况做了较为详细的罗列。

2008年秋，A通过其他渠道得知B在分家协议中隐瞒部分事实，其中包括：

1、约5万元的收入未列入分家协议，A已经取得B签署的客户合同书，但仍未取得客户的相关付费票据;

2、B在罗列其中一家门店的开办费中有明显夸大的嫌疑，额度约为9万元。

分析：1、A若想通过诉讼主张权利，首先要过立案这一关，因为A对该等权利是否成为法律上的适格原告存在疑问，也即是否能够直接承认A、B的这种个人合伙关系;两家门店从法律上为甲公司的两家分公司，分公司并无独立法人资格，即使立案成功也必将追加甲公司为本案第三人参加诉讼。2、对于B藏匿的5万元收入，A需取得相关的客户付款凭证作为证据。

3、对于B多出的9万元开支，A应要求B提供相应发票或单据，并论证该多余的9万元开支不符合市场的一般价格。

结论：本案在实践中可以通过诉讼解决，我方需协调好甲公司方面并尽量争取甲公司的支持。