股东允许他人擅自出资是否合法。公司股东在其他股东不知情的情况下同意他人的股份是违法的。根据《公司法》的有关规定，允许出资入股实际上增加了公司的注册资本，公司章程也需要修改，应当经股东大会决议通过。相关的法律依据可以参照《公司法》的下列规定：

第二十七条股东可以以货币出资，也可以以实物、知识产权、土地使用权和其他可以以货币计价并依法转让的非货币财产出资；但是，法律、行政法规规定不能作为出资的财产除外。对作为出资的非货币性财产的价值，应当进行评估、核实，不得高估或者低估。法律、行政法规对估价有规定的，从其规定。股东会行使下列职权：（一）决定公司的经营方针和投资计划；（二）选举和更换非职工代表的董事、监事，决定董事、监事的报酬事项；（三）审议批准董事会的报告；（四）审议批准监事会或者监事会的报告；（五）审议批准公司的年度报告；（六）审议批准公司的利润分配方案和弥补亏损方案；（七）审议批准公司的年度报告对公司增加或者减少注册资本作出决议；（八）对发行公司债券作出决议；（九）对公司合并、分立、解散、清算或者变更公司形式作出决议；（10）修改公司章程（十一）公司章程规定的其他职权。股东对前款所列事项书面一致同意的，可以不召开股东会直接作出决定，并由全体股东在决定文件上签名、盖章。

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