公务员违纪违法调查结束作出处分决定后，在处分期间可以办理退休手续。但在调查期间，不得办理退休手续。公务员有违纪违法行为的，纪律机关对公务员可以进行调查，经调查确实有违纪违法行为的，可以作出纪律处分，如警告、记过、降级等。

《行政机关公务员处分条例》第三十八条

行政机关公务员违法违纪，已经被立案调查，不宜继续履行职责的，任免机关可以决定暂停其履行职务。被调查的公务员在违法违纪案件立案调查期间，不得交流、出境、辞去公职或者办理退休手续。

第五十二条

有违法违纪行为应当受到处分的行政机关公务员，在处分决定机关作出处分决定前已经退休的，不再给予处分；但是，依法应当给予降级、撤职、开除处分的，应当按照规定相应降低或者取消其享受的待遇。