国有土地所有权由国务院代表国家行使，是指国务院代表国家依法行使对国有土地的占有、使用、收益和处分的权利。在法律上规定国务院是国有土地所有权的代表，一是明确地方各级人民政府不是国有土地所有权代表，无权擅自处置国有土地，只能依法根据国务院的授权处置国有土地；二是赋予中央人民政府行使国有土地资产经营管理的职能；三是明确国有土地的收益权归中央人民政府，国务院有权决定国有土地收益的分配办法。

一、办理国有土地证的流程

国有土地证办理流程如下：

1、由土地使用者向土地所在地的县级以上人民政府土地行政主管部门提出办理国有土地使用证的申请；

2、提交申请书、身份证明、出让协议等材料；

3、材料审核通过后，核发国有土地使用权证书。

根据《土地管理法实施条例》第五条第一款的规定，单位和个人依法使用的国有土地，由土地使用者向土地所在地的县级以上人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级以上人民政府登记造册，核发国有土地使用权证书，确认使用权。其中，中央国家机关使用的国有土地的登记发证，由国务院土地行政主管部门负责，具体登记发证办法由国务院土地行政主管部门会同国务院机关事务管理局等有关部门制定。

二、怎么办理商品房的土地使用权证

办理商品房的土地使用权证流程如下：

1、与市、县人民政府土地管理部门签订土地使用权出让合同；

2、根据合同约定，缴纳全部土地出让金；

3、持有出让合同等材料到不动产登记机构办理土地使用权证。

根据《土地管理法实施条例》第五条第一款的规定，单位和个人依法使用的国有土地，由土地使用者向土地所在地的县级以上人民政府土地行政管理部门提出土地登记申请，由县级以上人民政府登记造册，核发国有土地使用权证书，确认使用权。其中，中央国家机关使用的国有土地的登记发证，由国务院土地行政主管部门负责，具体登记发证办法由国务院土地行政管理主管部门会同国务院机关事务管理局等有关部门制定。