撤销权的行使在实际操作中存在的问题是：

1、债权人通过诉讼主张撤销权以谁为被告的问题。

债权人行使撤销权必须由享有撤销权的债权人以自己的名义向法院提起诉讼，但撤销之诉的被告究竟是债务人还是与债务人发生交易行为的第三人以及转得人，这个问题尚无法律规定，有实践中的具体应用，大致有三种观点：

(1)如果债务人实施的是单方行为，如单方免除债务，则应以债务人为被告

(2)债务人与相对人通过合同行为转移财产，则应以债务人和相对人为被告;

(3)如果债务人与相对人实施的处分财产行为只是达成协议而尚未交付，可仅以债务人为被告，撤销其不当处分财产的行为，如果财产已交付，相对人和受益人已经实际占有财产，则应将相对人和受益人列为共同被告，对于以上三种观点，笔者认为应从债权人行使撤销权的法律效果上看，无论何种情形都应将债务人与相对人和受益人列为共同被告，理由是债务人的行为一旦被撤销则该行为自始无效，对相对人和受益人效力也应是有约束力的，如果不能对他们生效也就不能请求相对人或受益人返还财产或折价赔偿债权人，行使撤销权也就失去了实际意义

2、债权人行使撤销权在举证上的问题。

我国民商法采用的举证原则是谁主张，谁举证，债权人行使撤销权必须对债务人放弃到期债权，无偿转让财产，以明显不合理低价转让财产以及对自己造成实际损害，受让人是否知道情形等负举证责任，但在实践中，市场主体之间的交易日益频繁，债务人的财产日趋多样化，出现了债权人行使撤销权时举证困难的问题。首先，对债务人放弃债权，无偿转让财产，因债权人对债务人财产掌握不够明确，以及现有的社会财产制度的局限，故举证困难;其次，是对债务人以明显不合理价格转让财产中，“不合理”的标准难已确定;另外对受让人明知会损害债权人的利益中，受让人是否明知举证困难;并且对于债务人处分自身所有的财产，处分哪些财产才会损害债权人的利益，难以界定，举证也十分困难。因此，在审判实践中，要具体问题具体分析，既要防止债权人随意行使撤销权，通过恶意诉讼干预债务人正常经营行为，又要充分考虑到债权人行使撤销权举证难这一实际情况。通过双方举证，一要审查债务人资产周转情况、不同行业的交易习惯，交易价格以及债务人诚信程度等基本情况;二要审查债务人处分财产的主观动机，是事实上的处分还是法律上的处分，处分财产是全部还是部分，是不良资产还是责任财产;三是审查确定债务人的处分财产行为是否有害于债权人的债权。