工程审计是一项既需要项目管理知识的广度，又需要造价专业知识的深度的一项工作。没有对项目全过程的系统性把握，就难以全面理解造价形成的过程，以及可能出现问题的环节。

1、合同管理方面

有的项目做完工程后再签合同；有得项目合同对关键性条款控制不严，例如：合同对工程的范围、内容、标准规定不明确；合同对结算条款规定不细致；合同规定的付款比例与有关规定不符，未预留质保金；合同对违约责任规定不足，缺乏对违约方的制约等等。

2、概算执行方面

有的项目实施过程不按照概算批复执行，例如：擅自提高建设标准；扩大建设范围；将不属于概算范围内的工程纳入项目建设；项目出现重大设计变更不报批等等。

3、设计管理方面

有的项目设计深度不够，重要数据提示不清，造成结算时候无据可依；有的项目只有部分设计图纸就开始招标，造成招标后造价失控；有的项目设计变更办理不规范，不按照实际的工程绘制附图，仅标注工程量，造成结算与实际不符；竣工图纸不按实际完成情况绘制，造成结算审核时不知道实际完成情况，减少的工程量没有扣除；设计图纸的编制单位不具备出图资格，出具假的设计变更等等。

4、甲供材料和设备管理方面

甲供材料和设备是工程项目中建设单位采购的工程物资，应按照工程的设计需要进行采购和发放。在有的工程项目中，甲供材料和设备的投资占比很大，如果管理不好，很容易成为某些人弄虚作假或滋生腐败的手段，所以在审计工作中必须重视这一部分。

5、工程管理方面

工程管理是项目实施的执行部分，是所有管理工作中最具体最直接的部分，涉及工程内容是否按照合同完成、签证的记录、工期能否满足合同条件、工程质量是否达到约定标准等等，所有的投资完成最后都要反映在工程的成果中，是工程结算最重要的参考。工程实施的过程也是工程成本形成的过程，其过程的记录对工程的结算具有重要意义。

6、结算管理方面

结算管理中问题有：图纸工程量计算、定额套取、取费、计税的错误；人材机价差计算错误；签证事项与实际不符；签证的事项已包括在合同范围内，重复计费；设计变更的工程量与实际不符；总价合同范围内的工程实际没有全部完成等等。