总承包施工合同备案费要具体问题具体分析。每个地方经济发展状况不同，施工所需要的工程量也不同，因此备案费是不同的。施工合同经常要遇到两类合同的计价问题，一是单价合同，一是总价合同。合同双方可按以下合同价款的方式在专用条款中作出约定：固定价合同、可调价合同与成本加酬金合同，对于承发包双方来说，采用不同的合同价形式意味着双方风险责任划分不同。现在普遍采用的是工程量清单计价基础上的可调价合同，双方在专用条款内约定合同价款调整因素及调整的方法。

一、建设工程施工合同被认定为无效后工程价款如何处理

建设工程施工合同被认定为无效后，工程款是否给付，如何给付，主要取决于建设工程质量是否合格：

（一）建设工程施工合同被确认无效后，如果建设工程质量合格的，可以参照合同约定结算工程款。这里的建设工程质量合格包括两种情况：一是建设工程经竣工验收合格；二是建设工程经竣工验收不合格，但经过承包人修复后，再验收合格。总之，只要建设工程经过验收合格，即使确认合同无效，也可以按照合同约定结算工程款。这里要注意的是，工程款是按合同约定结算，而不是通过司法鉴定认定工程款，这样规定的主要目的是体现当事人在订立合同时的真实意思表示，同时也是为了节约鉴定成本，提高诉讼效率。否则，就可能出现按无效合同应付的工程款比按有效合同支付的工程款给付还多的情况，从而失去认定合同无效的积极意义。

（二）对质量不合格又不能修复的工程可以不支付工程价款。这主要是因为：第一，如果承包人交付的建设工程质量不合格，发包人订立合同的目的就无法实现，发包人不仅可以拒绝受领该工程，而且也可以不支付工程款；第二，如果经修复，该建筑工程仍然不合格，就意味着该工程没有利用价值，在这种情况下，让发包人支付工程款，显然是不公平的；对因质量不合格所造成的损失，应由责任人承担。当然，如果发包人对质量不合格也存在过错的，由双方按过错程度来承担责任。